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基于新一代高通量測序技術分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii誘導處理櫻桃番茄果實后轉(zhuǎn)錄組學的變化
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 131 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 唐瓊,鄭曉冬
關鍵詞: 羅倫隱球酵母;櫻桃番茄;轉(zhuǎn)錄組學;實時熒光定量聚合酶鏈式反應
摘要:

羅倫隱球酵母(Cryptococcus laurentii)作為生物激發(fā)子,能顯著誘導采后櫻桃番茄對灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的抗性響應,但其防治機制尚未完全明確。本實驗以櫻桃番茄為材料,利用新一代高通量測序技術Illumina HiSeqTM4000對羅倫隱球酵母處理及水對照處理的番茄果肉組織進行轉(zhuǎn)錄組測序,采用生物信息學方法對差異基因進行功能注釋和通路分析,并利用實時熒光定量聚合酶鏈式反應(real time-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)技術對隨機選取的差異表達基因進行驗證。結(jié)果表明,櫻桃番茄果實經(jīng)過羅倫隱球酵母誘導處理48?h后,共有3?141?個基因差異表達,上、下調(diào)表達基因分別為1?689?個和1?452?個,這些差異表達基因涉及多個代謝路徑,揭示羅倫隱球酵母對番茄的誘導作用是一個多代謝路徑參與的調(diào)控過程。此外,RT-qPCR驗證結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果趨勢一致。

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