環(huán)糊精可作為主體通過超分子相互作用與客體分子形成包合物,從而起到保護或增強客體分子性質(zhì)的作用。分子模擬是探究該相互作用的一種重要研究手段,在環(huán)糊精包合反應(yīng)中得到了廣泛的應(yīng)用。本文首先對分子模擬進行概述,主要包括量子力學、分子對接和分子動力學模擬;其次,分別總結(jié)了分子對接和分子動力學模擬的基本原理、主流軟件及常用力場等,之后分別從分子結(jié)構(gòu)變化表征、分子間相互作用表征、溶劑效應(yīng)及協(xié)同穩(wěn)定4 個方面總結(jié)了其在研究環(huán)糊精包合過程中的應(yīng)用進展;研究表明,疏水空腔的大小及客體在空腔內(nèi)的初始方向?qū)腕w/環(huán)糊精包合物結(jié)構(gòu)都有非常重要的影響;范德華相互作用是環(huán)糊精包合反應(yīng)的主要推動力,分子間氫鍵的形成是包合物穩(wěn)定的重要因素;顯式溶劑模型是研究環(huán)糊精包合反應(yīng)溶劑效應(yīng)的有利工具;最后,作者認為對于環(huán)糊精包合過程,可從多尺度及機器學習兩方面,結(jié)合分子模擬進行后續(xù)相關(guān)研究。
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