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益生菌劑調(diào)整腸道疾病人群菌群結(jié)構(gòu)豐度水平的研究
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 237 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 臧凱麗,江 巖,孫 勇,閆亞麗,陳慶森,趙林森,趙 培,崔文靜,馬新穎
關(guān)鍵詞: 益生菌劑|腸道疾病|菌群豐度|Ion Torrent PGM測序技術(shù)|生物信息學(xué)
摘要:

為探究益生菌劑對腸道疾病人群菌群多樣性及豐度水平的調(diào)節(jié)能力。本研究以健康、便秘、腹瀉及腹脹、 腸易激綜合征患者、排便不規(guī)律等人群為對象,使其定時、定量攝入益生菌劑(probotic preparations,PPrs)共6 周, 采集新鮮糞便樣品并提取DNA,利用Ion Torrent PGM測序技術(shù)進行16S rRNA V3區(qū)擴增子測序,并聯(lián)合生物信息學(xué) 和多變量統(tǒng)計學(xué)分析方法對測序數(shù)據(jù)進行多樣性分析。在測序深度滿足要求的情況下,從門、科、屬乃至種4 個水 平由淺至深挖掘益生菌劑對各受試人群腸道菌群失調(diào)的調(diào)節(jié)作用。所有測序序列在97%相似水平劃分得到2 320 個 分類操作單元,擬桿菌門(Bacteroidetes)、硬壁菌門(Firmicutes)、變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門 (Actinobacteria)為各組的優(yōu)勢菌門,占總序列數(shù)的99.81%。益生菌劑對各組受試人群的共性特征是:毛螺菌科 (Lachnospiraceae)的調(diào)整均有長期的積極作用,而產(chǎn)堿桿菌科(Alcaligenaceae)、理研菌科(Rikenellaceae)、 雙歧桿菌科(Bifidobacteriaceae)等優(yōu)勢菌科在干預(yù)停止后又恢復(fù)至干預(yù)前的狀態(tài)。益生菌劑對各種疾病狀態(tài)人 群的作用存在差異,便秘組的藍細菌門(Cyanobacteria)和梭桿菌門(Fusobacteria)均從無到有。經(jīng)主成分分 析(principal component analysis,PCA)鑒定顯示,在干預(yù)第1~4周期間,益生菌劑對腹瀉組屬水平的調(diào)整優(yōu)于 其他兩組,柔嫩梭菌屬(Faecalibacterium)、不動桿菌屬(Acinetobacter)、布勞特氏菌屬(Blautia)、梭菌屬 (Clostridium)、小類桿菌屬(Dialister)、埃格特菌屬(Eggerthella)、顆粒鏈菌屬(Granulicatella)、乳桿菌屬 (Lactobacillus)、草酸桿菌屬(Oxalobacter)、Pyramidobacter等10 個屬多樣性及相對豐度均有明顯的提升;便 秘組僅有普氏菌屬(Prevotella)、巨單胞菌屬(Megamonas)、柯林斯菌屬(Collinsella)3 個屬相對豐度變化; 其他組的Adlercreutzia、Collinsella、克雷白氏桿菌屬(Klebsiella)、Parabacteroides、薩特氏菌屬(Sutterella)5 個 屬有相對豐度的變化。PCA分析還揭示了益生菌劑在不同腸道疾病個體菌群結(jié)構(gòu)的調(diào)整方面存在明顯的差異,對不 同腸道疾病的改善及治療作用也不一樣。另外,便秘組的Bacteroides和Odoribacter有降低的趨勢,且回復(fù)到與對照 組接近的狀態(tài)。經(jīng)熱圖分析鑒定發(fā)現(xiàn),Akkermansia muciniphila、Bacteroides fragilis、Faecalibacterium prausnitzii等 幾種已被認定功效的關(guān)鍵菌階段性地出現(xiàn),但是停止干預(yù)后即消失,原有的Bacteroides ovatus開始降低,這些菌的 出現(xiàn)對維護宿主健康具有價值。綜上所述,該益生菌劑干預(yù)能起到改變腸道微生物多樣性的功效,并具有調(diào)整菌群 豐度水平的作用,表現(xiàn)出了抑制腸道有害微生物生長的作用,特別是對腸道健康有益菌的出現(xiàn)更體現(xiàn)出該益生菌劑 的生理功效;因此,該益生菌劑應(yīng)用于維持腸道菌群結(jié)構(gòu)的穩(wěn)態(tài)具有廣闊的市場前景。

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