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—— 中國食品雜志社
目的：比較涂抹法和沖洗法對冷鮮雞表面細菌DNA提取及高通量測序結(jié)果的影響。方法：將4?只冷鮮雞對半分開，分別采用涂抹法和沖洗法采集其表面微生物，提取基因組DNA，對細菌16S rRNA基因V3～V4區(qū)進行聚合酶鏈式反應(yīng)擴增，通過Illumina Hiseq測序平臺對擴增產(chǎn)物進行高通量測序，使用QIIME等軟件對測序序列進行分析統(tǒng)計。結(jié)果：兩種方法采集的樣品在細菌基因組DNA提取、菌群豐富度、多樣性及菌群結(jié)構(gòu)等方面均無顯著差異（P＞0.05）。高通量測序結(jié)果表明，冷鮮雞表面細菌菌群主要分布于7?個門，10?個屬。變形菌門為優(yōu)勢菌門，占70%以上；希瓦氏菌屬、假單胞菌屬、不動桿菌屬、嗜冷桿菌屬和環(huán)絲菌屬為優(yōu)勢菌屬，分別占10%～20%。結(jié)論：兩種采樣方法對冷鮮雞表面細菌DNA提取及高通量測序沒有明顯影響，但沖洗法比涂抹法簡單易行，且不易發(fā)生二次污染，因此更具有實用性。本實驗同時也為冷鮮雞表面細菌的研究提供了數(shù)據(jù)資料。
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