為建立植物乳桿菌天然質(zhì)粒分類方法,以質(zhì)粒復(fù)制起始蛋白(replication initiation protein,Rep)作為分類標(biāo)記,通過系統(tǒng)進(jìn)化樹分析方法,將植物乳桿菌53?個(gè)編碼Rep天然質(zhì)粒劃分為6?個(gè)質(zhì)粒類型,包括5?個(gè)質(zhì)粒家族和1?個(gè)新的復(fù)制類型質(zhì)粒,之后進(jìn)一步提出了每個(gè)質(zhì)粒家族特有的骨干序列,最終建立了一種簡單、有效的植物乳桿菌天然質(zhì)粒的分類方法和標(biāo)準(zhǔn)。與以往質(zhì)粒功能和不相容性分類方法相比較,本方法具有較好的實(shí)用性和通用性。
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