地膚子中的木鱉子皂苷Ic和2’-O-β-D-吡喃葡萄糖木鱉子皂苷Ic有較強抑制腎素體外活性的功能。分子對接證實兩皂苷與腎素結(jié)合較好,分別形成9 個和4 個氫鍵,氨基酸Ser230與Tyr231是氫鍵作用的關(guān)鍵殘基,而Ala229、Met303、His301、Asp38、Arg82、Tyr83與Ile137則對疏水結(jié)合起重要作用。分子動力學模擬約1 000 ps后,兩復合物平衡,均方根偏差分別為0.224 nm和0.219 nm,兩皂苷降低了腎素鏈開始約160 個氨基酸的均方根波動。分子力學泊松-波爾茲曼表面積法獲得的結(jié)合自由能分別為-44.36 kcal/mol與-62.46 kcal/mol,其中主要驅(qū)動力是靜電和范德華作用,而極性溶劑化能則強烈阻礙結(jié)合。3 種方法綜合揭示了兩種地膚子皂苷抑制腎素的分子機制。
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