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高通量測序與傳統(tǒng)純培養(yǎng)方法在牡蠣微生物群落分析中的應(yīng)用對比
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 149 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 曹 榮,張 井,孟輝輝,趙 玲,劉 淇
關(guān)鍵詞: 高通量測序|牡蠣|微生物群落結(jié)構(gòu)
摘要:

為揭示牡蠣體附著的微生物群落結(jié)構(gòu)特征,采用Illumina HiSeq高通量測序技術(shù)對牡蠣的細(xì)菌種類進(jìn)行了分析,并與傳統(tǒng)純培養(yǎng)方法的分析結(jié)果進(jìn)行對比。結(jié)果表明,牡蠣體附著的細(xì)菌以變形菌門(Proteobacteria,77.5%)、γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria,72.3%)為主;在目的分類水平上,弧菌目(Vibrionales,49.3%)、交替單胞菌目(Alteromonadales,12.2%)占優(yōu)勢;在科的分類水平上,主要是弧菌科(Vibrionaceae,36.8%)、希瓦氏菌科(Shewanellaceae,10.3%)和交替假單胞菌科(Pseudoalteromonadaceae,7.2%);在屬的分類水平上,弧菌屬(Vibrio,28.3%)、希瓦氏菌屬(Shewanella,10.3%)、交替假單胞菌屬(Pseudoalteromonas,7.2%)比例相對較高。高通量測序分析結(jié)果中,豐度前3 位的菌屬與純培養(yǎng)鑒定的結(jié)果一致,但比例有所差異。

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