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驢乳外泌體中miRNA的測序與分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 156 發(fā)表時間: 2022-10-24
作者: 柴玉霞,王新宇,岳喜慶,楊梅
關(guān)鍵詞: 驢乳外泌體;人乳外泌體;miRNA;Illumina測序
摘要:

為探究驢乳外泌體中微小RNA(miRNA)的種類和功能性,利用Illumina測序技術(shù)對驢乳外泌體中非編碼小RNA(sRNA)進(jìn)行測序分析,鑒定其中的miRNA并以人乳外泌體miRNA作為對照組進(jìn)行生物信息學(xué)分析。驢乳外泌體中sRNA在質(zhì)量控制之后,長度主要分布在18~22 nt,在其中共鑒定到212 個miRNA,其中包括16 種已知miRNA和196 種新miRNA。基因本體論富集分析發(fā)現(xiàn),驢乳外泌體miRNA的功能性與人乳相似,構(gòu)成細(xì)胞、細(xì)胞器等組分;具有結(jié)合和催化活性等功能;參與細(xì)胞代謝、生物調(diào)節(jié)等過程。京都基因與基因組百科全書通路富集分析發(fā)現(xiàn),驢乳外泌體miRNA參與醛固酮的合成與分泌、Hedgehog信號、線粒體調(diào)節(jié)、癌癥等通路。

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