為獲得高質(zhì)量腸道細菌總DNA用于研究膳食纖維對大鼠腸道菌群的影響,本實驗以SD大鼠為實驗動物,灌胃番茄皮膳食纖維,收集大鼠糞便及盲腸,-70℃冰箱保存。分別采用Tiangen細菌基因組試劑盒法、蛋白酶K-十六烷基三甲基溴化銨 (CTAB)法和溶菌酶法提取糞便和腸道中的細菌總DNA,通過瓊脂糖凝膠電泳、細菌通用引物PCR擴增和變性梯度凝膠電泳(DGGE)對提取效果進行觀察比較,發(fā)現(xiàn)將溶菌酶法進行改進后,可以獲得滿意效果。改進后的溶菌酶法與另外兩種方法比較,具有成本低、時間短、DNA得率高和多樣性好等特點;該方法獲得的DNA樣品適合于用DGGE技術(shù)分析大鼠糞便及腸道菌群。
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