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1 株產(chǎn)VB12球形賴氨酸芽孢桿菌C5.1的分離、全基因組測(cè)序及分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 134 發(fā)表時(shí)間: 2023-05-16
作者: 趙磊,徐瓊,劉洋,張奕南,鐘江
關(guān)鍵詞: 發(fā)酵食品;賴氨酸芽孢桿菌;VB12;全基因組測(cè)序;基因功能注釋
摘要:

為深入探究球形賴氨酸芽孢桿菌C5.1(Lysinibacillus sphaericus C5.1)菌株產(chǎn)VB12的作用機(jī)制,利用PacBio Sequel和Illumina NovaSeq PE150相結(jié)合的方法對(duì)C5.1菌株進(jìn)行全基因組測(cè)序,并對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接、基因預(yù)測(cè)及功能注釋。結(jié)果表明,C5.1菌株基因組為一個(gè)環(huán)狀DNA,不含質(zhì)粒,大小為4 690 817 bp,GC含量為37.21%,預(yù)測(cè)得到4 756 個(gè)編碼基因,111 個(gè)tRNA基因和34 個(gè)rRNA基因。通過基因本體論、直系同源集、京都基因與基因組百科全書和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白分類數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)C5.1菌株基因組進(jìn)行注釋分析,分別匹配到3 095、3 182、4 374 個(gè)和397 個(gè)基因。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)C5.1菌株基因組中包含從尿卟啉原III逐步轉(zhuǎn)化合成VB12的關(guān)鍵酶。本研究為解析C5.1菌株在臭腐乳發(fā)酵過程中的代謝機(jī)理提供遺傳信息基礎(chǔ),也為今后開展發(fā)酵食品中VB12的生物合成機(jī)制研究提供理論支撐。

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