應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技術(shù)對黃山臭鱖魚發(fā)酵過程中的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成進(jìn)行研究。以發(fā)酵0~8 d的臭鱖魚為研究對象,每2 d取樣,提取樣品的總DNA,同時進(jìn)行16S rDNA V6~V8區(qū)的PCR擴(kuò)增,產(chǎn)物純化后進(jìn)行DGGE分析。結(jié)果表明:腸球菌(Enterococcus sp.,D帶)、腐敗西瓦氏菌(Shewanella putrefaciens,C帶)、溶酪大球菌(Macrococcus caseolyticus,A帶)和乙酰微小桿菌(Exiguobacterium acetylicum,F(xiàn)帶)在整個發(fā)酵過程,特別是發(fā)酵后期占較大比例,是黃山臭鱖魚發(fā)酵過程中的優(yōu)勢菌。臭鱖魚樣品的PCR-DGGE圖譜相似度分析顯示,臭鱖魚發(fā)酵后期菌群結(jié)構(gòu)比較相似,微生物菌落結(jié)構(gòu)趨于穩(wěn)定。本研究結(jié)果為篩選適合工業(yè)化生產(chǎn)的發(fā)酵菌株,有效控制臭鱖魚生產(chǎn)中存在的腐敗菌、致病菌,對提高臭鱖魚安全性和產(chǎn)品品質(zhì)具有一定應(yīng)用價值。
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