目的:探究酸脅迫和非酸脅迫條件下鼠傷寒沙門氏菌(Salmonella typhimurium)的轉(zhuǎn)錄組反應(yīng),分析差異基因(differentially expressed genes,DEGs)表達(dá)水平,闡明酸脅迫影響鼠傷寒沙門氏菌耐酸反應(yīng)(acid tolerance response,ATR)的相關(guān)代謝通路。方法:對(duì)鼠傷寒沙門氏菌進(jìn)行酸脅迫處理,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)分析相關(guān)DEGs,并通過實(shí)時(shí)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果:經(jīng)酸脅迫后,共篩選到683 個(gè)DEGs,其中上調(diào)343 個(gè),下調(diào)340 個(gè)。其中涉及細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、氨基酸代謝、細(xì)胞膜組成等通路上調(diào)能夠使鼠傷寒沙門氏菌快速適應(yīng)酸環(huán)境;碳水化合物代謝相關(guān)通路上調(diào)能夠?yàn)槭髠抽T氏菌快速適應(yīng)酸環(huán)境提供更多的能量,與此同時(shí),嘧啶代謝等能量代謝通路下調(diào)能夠使鼠傷寒沙門氏菌降低能量消耗以維持上述的必需代謝過程;細(xì)菌應(yīng)激調(diào)控相關(guān)通路上調(diào)賦予鼠傷寒沙門氏菌交叉保護(hù)抗性;鞭毛、外膜蛋白、脂多糖等毒力相關(guān)基因表達(dá)上調(diào)增強(qiáng)了鼠傷寒沙門氏菌的毒力。real-time PCR驗(yàn)證結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析表達(dá)趨勢(shì)一致。結(jié)論:酸脅迫顯著提高了鼠傷寒沙門氏菌的耐酸能力,其中與代謝和細(xì)胞過程相關(guān)的通路發(fā)揮主要作用,本研究結(jié)果為進(jìn)一步了解該菌的酸脅迫反應(yīng)及更好地控制其在食品中的污染提供了理論依據(jù)。
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