應(yīng)用IEDB、DNAStar、DNAMAN和SnapGene等生物信息學(xué)工具對草莓輕型黃邊病毒外殼蛋白的氨基酸殘 基序列進行分析。選擇一段抗原性較強的肽段(位于外殼蛋白27~38氨基酸殘基處),依據(jù)大腸桿菌(Escherichia coli)的密碼子偏好性化學(xué)合成了該肽段的DNA編碼序列(AE)。AE片段克隆至E. coli表達載體pET32a(+) 的EcoRⅠ和XhoⅠ位點,獲得重組質(zhì)粒pET32a(+)-AE。含AE片段的開放閱讀框長561 bp,編碼了一個187氨 基酸殘基的重組融合蛋白,理論分子質(zhì)量為20.29 kD。重組質(zhì)粒pET32a(+)-AE分別在E. coli BL21(DE3)和 E. coli Rosetta中進行了誘導(dǎo)表達和條件優(yōu)化。重組融合蛋白在E. coli Rosetta中的最佳表達條件為1.5 mmol/L異丙 基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside,IPTG)、35 ℃誘導(dǎo)表達2 h,產(chǎn)率為13.22 mg/L;在 E. coli BL21(DE3)中的最佳表達條件是為0.5 mmol/L IPTG、30 ℃誘導(dǎo)表達2 h,產(chǎn)率為9.55 mg/L。重組融合蛋白 經(jīng)十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離、質(zhì)譜鑒定表明,其含有所預(yù)測的草莓輕型黃邊病毒外殼蛋白抗原表 位肽段AE。AE重組融合蛋白經(jīng)Ni2+親和色譜純化、EK酶切、分子篩除去融合蛋白標(biāo)簽后,免疫產(chǎn)蛋雞。從免疫雞 所產(chǎn)雞蛋中提取雞卵黃免疫球蛋白(immunoglobulin of yolk,IgY),Dot-Blot檢測抗體結(jié)合活性。結(jié)果表明,所提 取的IgY可特異性識別AE肽段和SMYEV外殼蛋白。這一結(jié)果表明所預(yù)測的AE肽段具有較好的免疫原性。
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